MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011312	GTTA	2	8	1060415	1060422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_011312	TCT	2	6	1061129	1061134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_011312	TCT	2	6	1061141	1061146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_011312	CAC	2	6	1061157	1061162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_011312	TCA	2	6	1061222	1061227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_011312	TTTA	2	8	1061317	1061324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011312	TCA	2	6	1061348	1061353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011312	T	7	7	1061415	1061421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_011312	ATT	2	6	1061440	1061445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_011312	TCA	2	6	1061522	1061527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_011312	CAA	2	6	1061559	1061564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_011312	ATTC	2	8	1061592	1061599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_011312	AAT	2	6	1061783	1061788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_011312	CTAATT	2	12	1061831	1061842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5015	NC_011312	ACC	2	6	1061844	1061849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_011312	CT	3	6	1061913	1061918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_011312	ACCAAG	3	18	1061925	1061942	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_011312	TGG	2	6	1061967	1061972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011312	AAT	2	6	1062067	1062072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011312	TGG	2	6	1062078	1062083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_011312	TCA	2	6	1062115	1062120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_011312	T	6	6	1062138	1062143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_011312	TA	3	6	1062160	1062165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011312	ATG	2	6	1062176	1062181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011312	TCA	2	6	1062199	1062204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_011312	CTT	2	6	1062260	1062265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_011312	AGC	2	6	1062309	1062314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_011312	GCT	2	6	1062341	1062346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_011312	CT	3	6	1062372	1062377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_011312	TTGA	2	8	1062488	1062495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011312	AGC	2	6	1062540	1062545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_011312	ATA	2	6	1062559	1062564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011312	T	7	7	1062628	1062634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_011312	GTT	2	6	1062700	1062705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011312	TTA	2	6	1062709	1062714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011312	T	6	6	1062743	1062748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011312	ATTA	2	8	1062759	1062766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011312	AGC	2	6	1062789	1062794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_011312	TAA	2	6	1062830	1062835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011312	CAG	2	6	1062942	1062947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_011312	TA	4	8	1062953	1062960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011312	ATC	2	6	1062981	1062986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_011312	GTT	2	6	1063006	1063011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011312	TAA	2	6	1063062	1063067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011312	TCA	2	6	1063072	1063077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_011312	T	7	7	1063172	1063178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011312	ATAC	2	8	1063184	1063191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_011312	TAT	2	6	1063236	1063241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011312	AGT	2	6	1063286	1063291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011312	AAAAG	2	10	1063301	1063310	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_011312	TA	3	6	1063325	1063330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011312	CTA	2	6	1063352	1063357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_011312	GAGAG	2	10	1063374	1063383	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011312	TATG	2	8	1063385	1063392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011312	CTGA	2	8	1063413	1063420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_011312	ATAA	2	8	1063474	1063481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_011312	ATT	2	6	1063516	1063521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_011312	T	7	7	1063520	1063526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_011312	AAT	2	6	1063553	1063558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_011312	GTAAC	2	10	1063566	1063575	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5061	NC_011312	ACA	2	6	1063586	1063591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_011312	ATTCA	2	10	1064690	1064699	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5063	NC_011312	GTT	2	6	1064743	1064748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011312	TGA	2	6	1064828	1064833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_011312	AAT	2	6	1071497	1071502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_011312	ATA	2	6	1071508	1071513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011312	T	6	6	1071571	1071576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011312	ATT	2	6	1071599	1071604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011312	AATCA	2	10	1071625	1071634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5070	NC_011312	ACG	2	6	1071636	1071641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_011312	T	6	6	1071675	1071680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_011312	TTGA	2	8	1071690	1071697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011312	AGGG	2	8	1071716	1071723	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011312	CAA	2	6	1071774	1071779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_011312	TCT	2	6	1071787	1071792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_011312	AAT	2	6	1071805	1071810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_011312	GTT	2	6	1071853	1071858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_011312	TA	5	10	1071875	1071884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_011312	TTG	2	6	1071930	1071935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_011312	TA	3	6	1071972	1071977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_011312	CGT	2	6	1071984	1071989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_011312	ATT	2	6	1072003	1072008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_011312	ATAC	2	8	1072009	1072016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_011312	GTT	2	6	1072018	1072023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_011312	ATT	2	6	1072090	1072095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_011312	AC	3	6	1072104	1072109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_011312	CAA	2	6	1072130	1072135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_011312	ATA	2	6	1072176	1072181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_011312	A	7	7	1072192	1072198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011312	AAT	2	6	1073253	1073258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_011312	GAA	2	6	1073329	1073334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_011312	TGC	2	6	1073385	1073390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_011312	AGA	2	6	1073430	1073435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_011312	AGCA	2	8	1073453	1073460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_011312	A	9	9	1073481	1073489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_011312	GCGG	2	8	1073524	1073531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_011312	A	6	6	1073572	1073577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_011312	TTG	2	6	1073615	1073620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011312	TAT	2	6	1073622	1073627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011312	TGA	2	6	1073652	1073657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011312	ATTT	2	8	1073675	1073682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_011312	TGA	2	6	1073706	1073711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_011312	TTG	2	6	1073812	1073817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011312	CTT	2	6	1073879	1073884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_011312	TTAC	2	8	1073889	1073896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_011312	GCA	2	6	1073903	1073908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_011312	CAG	2	6	1073919	1073924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_011312	TAA	2	6	1074003	1074008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_011312	ACA	2	6	1074067	1074072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_011312	TGA	2	6	1074111	1074116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_011312	GTT	2	6	1074118	1074123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011312	TAG	2	6	1074177	1074182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011312	G	6	6	1074212	1074217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_011312	TAAA	2	8	1074264	1074271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011312	T	6	6	1074294	1074299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_011312	TCT	2	6	1075905	1075910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_011312	AGCG	2	8	1075946	1075953	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_011312	TGAC	2	8	1075985	1075992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_011312	TAA	2	6	1076034	1076039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_011312	AG	3	6	1076073	1076078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011312	TAA	2	6	1076266	1076271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_011312	T	7	7	1076375	1076381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_011312	TAA	2	6	1076415	1076420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_011312	TTTA	2	8	1076450	1076457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_011312	ATAA	2	8	1076476	1076483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_011312	ATA	2	6	1076499	1076504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_011312	T	8	8	1078409	1078416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_011312	ATTA	2	8	1078434	1078441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_011312	TA	3	6	1078483	1078488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_011312	TGCT	2	8	1079838	1079845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_011312	TAT	3	9	1079865	1079873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_011312	ATT	2	6	1079903	1079908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_011312	GTA	2	6	1079920	1079925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5135	NC_011312	T	6	6	1082368	1082373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_011312	ATT	2	6	1082374	1082379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_011312	TAAA	2	8	1119333	1119340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_011312	A	7	7	1119352	1119358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5256	NC_011312	AGTT	2	8	1119921	1119928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_011312	ACTAA	2	10	1119952	1119961	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5258	NC_011312	AAT	2	6	1119965	1119970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_011312	GCTG	2	8	1120888	1120895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5260	NC_011312	GTCG	2	8	1120910	1120917	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5261	NC_011312	ATTG	2	8	1120944	1120951	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_011312	TTG	2	6	1120955	1120960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5265	NC_011312	TTA	2	6	1121068	1121073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5399	NC_011312	T	6	6	1171582	1171587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5400	NC_011312	ATT	2	6	1171601	1171606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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